Базальные клетки, являющиеся маленькими круглыми структурами с крупным ядром, размещенным в центре, образуются на внутренней зоне базального слоя эпидермиса. В цитоплазме таких клеток обнаруживаются зерна меланина, а также значительное число тончайших ниточек (тонофиламентов), которые объединяются в опорные волокна, называемые тонофибриллами. Базальные клетки фиксируются на базальных мембранах посредством пальцеобразных выростов с полудесмосомами.
Они представляют собой малодифференцированные клетки, демонстрирующие способности к митотическому делению, то есть, входят в состав постоянно обновляющихся тканей. Это означает, что базальные клетки являются своеобразными источниками для запуска регенерационных процессов, которые обеспечивают восстановление тканей в случае гибели части живых клеток. Ход регенерационных процессов в значительной степени обусловлен особенностями гистогенеза тканей конкретного живого организма.
Ввиду способности к митотическому делению именно базальные клетки составляют так называемый «опухолевый зачаток», из которого развиваются различные новообразования.